No es exacto lo que mencionas. El comando apt-get dist-upgrade solo actualiza el Kernel. Por ejemplo si tenemos un Linux Kernel 3.16.50 se actualizaraá 3.16.51. Si la versión de distro en Ubuntu 14.04 después del comando mencionado seguirá siendo Ubuntu 14.04. Yo no utilizo las actualizaciones automáticas, sino que siempre actualizo desde la terminal (sudo apt-get update & sudo apt-get upgrade & sudo apt-get dist-upgrade).
Saludos